蛋白质数据银行（Protein Data Bank，简称PDB）是一个全球性的生物大分子结构数据库，它收集并存储了蛋白质、核酸、糖蛋白等生物大分子的三维结构信息。自1971年由美国Brookhaven国家实验室创建以来，PDB已经成为结构生物学领域不可或缺的资源，为科研人员提供了一个宝贵的数据共享平台。
PDB数据库的建立基于一个重要的科学发现：蛋白质的氨基酸序列包含了决定其三维结构的全部信息。这一理论基础由Anfinsend小组在20世纪60年代提出，并因此获得了诺贝尔奖。蛋白质的结构是其生物学功能的基础，而PDB数据库正是为了帮助科研人员更好地理解蛋白质结构与其功能之间的关系。
PDB数据库中的数据主要来源于实验方法，如X射线晶体学、核磁共振（NMR）和冷冻电子显微镜技术等。这些方法可以精确地测定分子中每个原子的位置，为科研人员提供了高分辨率的蛋白质结构信息。随着科学技术的发展，PDB数据库也在不断地扩展和更新，以反映全球实验室的最新研究成果。
PDB数据库的应用非常广泛。科研人员可以通过数据挖掘和统计分析，探索蛋白质序列与结构之间的联系，从而加深对蛋白质结构决定机理的理解。此外，PDB数据库还为蛋白质二级结构预测、药物设计、疾病机理研究等领域提供了重要的数据支持。
为了更好地服务于科研人员，PDB数据库提供了多种数据检索和分析工具。用户可以根据自己的研究需求，通过关键词、序列相似性、结构特征等多种方式进行数据检索。同时，PDB数据库还提供了三维可视化工具，帮助用户直观地理解蛋白质的三维结构。
随着基因组学的发展，蛋白质结构预测的需求日益增长。PDB数据库中的已知结构为蛋白质结构预测提供了重要的参考。通过比较已知结构，科研人员可以预测新发现蛋白质的三维结构，从而加速蛋白质功能的研究。
PDB数据库的维护和发展是一个国际合作的成果。由结构生物信息学研究合作组织（Research Collaboratory for Structural Bioinformatics，简称RCSB）负责维护，确保了数据库的质量和可用性。此外，PDB数据库还与其他数据库如SCOP和CATH等建立了合作关系，共同推动生物信息学的发展。
总之，PDB数据库是一个宝贵的科研资源，它不仅为科研人员提供了丰富的蛋白质结构数据，还推动了生物信息学和结构生物学的发展。随着科学技术的进步和国际合作的加强，PDB数据库将继续为生命科学研究提供强有力的支持。
